空調污染引起的傳染性疾病主要是軍團菌病。這種病是由空調中的軍團菌所引起的可致死疾病，多為散發(fā)或小流行，也可爆發(fā)流行。發(fā)病特征為肺炎伴全身性毒血癥癥狀，嚴重者出現(xiàn)周圍回圈衰竭、呼吸衰竭。我國自1982年在南京發(fā)現(xiàn)首例病人以來，包括香港和臺灣地區(qū)，相繼有軍團菌病暴發(fā)和個別病例的報道。

空調污染所引起的過敏癥包括過敏性鼻炎、哮喘、過敏性肺泡炎等。引起過敏癥的過敏原包括細菌、真菌、塵螨等。這些過敏原可能來自室外空氣，也可能來自空調系統(tǒng)，如通風管道里沉積的顆粒物、冷卻塔、加濕器產(chǎn)生的微生物氣溶膠等。

不良建筑綜合征。亦稱為病態(tài)建筑物綜合征或寫字樓綜合征，是活動在不良建筑內的人群產(chǎn)生的眼、鼻和咽喉剌激癥、頭痛、疲勞、全身不適等一系列自覺癥狀，這些癥狀在離開該建筑物之后可以得到改善和消失。

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