現(xiàn)在，大家都認(rèn)識(shí)到分子論和原子論是個(gè)有機(jī)聯(lián)系的整體，它們都是關(guān)于物質(zhì)結(jié)構(gòu)理論的基本內(nèi)容。然而在阿佛加德羅提出分子論后的50年里，人們的認(rèn)識(shí)卻不是這樣。原子這一概念及其理論被多數(shù)化學(xué)家所接受，并被廣泛地運(yùn)用來推動(dòng)化學(xué)的發(fā)展，然而關(guān)于分子的假說卻遭到冷遇。阿佛加德羅發(fā)表的關(guān)于分子論的第一篇論文沒有引起任何反響。3年后的1814年，他又發(fā)表了第二篇論文，繼續(xù)闡述他的分子假說。也在這一年，法國物理學(xué)家安培，就是那個(gè)在電磁學(xué)發(fā)展中有重要貢獻(xiàn)的安培也獨(dú)立地提出了類似的分子假說，仍然沒有引起化學(xué)界的重視。已清楚地認(rèn)識(shí)到自己提出的分子假說在化學(xué)發(fā)展中的重要意義的阿佛加德羅很著急，在1821年他又發(fā)表了闡述分子假說的第三篇論文，在文中他寫道：“我是第一個(gè)注意到蓋·呂薩克氣體實(shí)驗(yàn)定律可以用來測(cè)定分子量的人，而且也是第一個(gè)注意到它對(duì)道爾頓的原子論具有意義的人。沿著這種途徑我得出了氣體結(jié)構(gòu)的假說，它在相當(dāng)大程度上簡(jiǎn)化了蓋·呂薩克定律的應(yīng)用�！痹谒v述了分子假說后，他感慨地寫道：“在物理學(xué)家和化學(xué)家深入地研究原子論和分子假說之后，正如我所預(yù)言，它將要成為整個(gè)化學(xué)的基礎(chǔ)和使化學(xué)這門科學(xué)日益完善的源泉。”盡管阿佛加德羅作了再三的努力，但是還是沒有如愿，直到他1856年逝世，分子假說仍然沒有被大多數(shù)化學(xué)家所承認(rèn)。
道爾頓的原子論發(fā)表后，測(cè)定各元素的原子量成為化學(xué)家最熱門的課題。盡管采用了多種方法，但因?yàn)椴怀姓J(rèn)分子的存在，化合物的原子組成難以確定，原子量的測(cè)定和數(shù)據(jù)呈現(xiàn)一片混亂，難以統(tǒng)一。于是部分化學(xué)家懷疑到原子量到底能否測(cè)定，甚至原子論能否成立。不承認(rèn)分子假說，在有機(jī)化學(xué)領(lǐng)域中同樣產(chǎn)生極大的混亂。分子不存在，分類工作就難于進(jìn)行下去，例如醋酸竟可以寫出19個(gè)不同的化學(xué)式。當(dāng)量有時(shí)等同于原子量，有時(shí)等同于復(fù)合原子量（即分子量），有些化學(xué)家干脆認(rèn)為它們是同義詞，從而進(jìn)一步擴(kuò)大了化學(xué)式、化學(xué)分析中的混亂。
無論是無機(jī)化學(xué)還是有機(jī)化學(xué)，化學(xué)家對(duì)這種混亂的局面都感到無法容忍了，強(qiáng)烈要求召開一次國際會(huì)議，力求通過討論，在化學(xué)式、原子量等問題上取得統(tǒng)一的意見。于是1860年9月在德國卡爾斯魯厄召開了國際化學(xué)會(huì)議。來自世界各國的140名化學(xué)家在會(huì)上爭(zhēng)論很激烈，但沒達(dá)成協(xié)議。這時(shí)意大利化學(xué)家康尼查羅散發(fā)了他所寫的小冊(cè)子，希望大家重視研究阿佛加德羅的學(xué)說。他回顧了50年來化學(xué)發(fā)展的歷程，成功的經(jīng)驗(yàn)，失敗的教訓(xùn)都充分證實(shí)阿佛加德羅的分子假說是正確的，他論據(jù)充分，方法嚴(yán)謹(jǐn)，很有說服力。經(jīng)過50年曲折經(jīng)歷的化學(xué)家此時(shí)已能冷靜地研究和思考，終于承認(rèn)阿佛加德羅的分子假說的確是扭轉(zhuǎn)這一混亂局面的唯一鑰匙。阿佛加德羅的分子論終于被確認(rèn)，阿佛加德羅的偉大貢獻(xiàn)終于被發(fā)現(xiàn)，可惜此時(shí)他已溘然長逝了。甚至沒有為后人留下一一張照片或畫像�，F(xiàn)在唯一的畫像還是在他死后，按照石膏面模臨摹下來的。
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