Nature Methods:新一代CRISPRs有望成為重磅技術(shù)

編輯: 逍遙路 關(guān)鍵詞: 高中生物 來(lái)源: 高中學(xué)習(xí)網(wǎng)


當(dāng)人們提到所謂的使能技術(shù)(enablingtechnologies),類似印刷機(jī)的發(fā)明,或者麻醉藥的發(fā)現(xiàn)就會(huì)浮現(xiàn)在我們腦海中。而對(duì)于科學(xué)家來(lái)說(shuō),CRISPR-Cas9系統(tǒng)就是這樣一種系統(tǒng)。

這種細(xì)菌免疫系統(tǒng)能通過(guò)將病毒DNA中的短重復(fù)片段整合到細(xì)菌基因組中,來(lái)抵抗病毒。當(dāng)細(xì)菌(或其后代)第二次感染病毒的時(shí)候,這些重復(fù)序列就能通過(guò)一種核酸酶靶向侵入的互補(bǔ)DNA,并摧毀它。

幾個(gè)研究組就利用了這一系統(tǒng)編輯真核生物基因,隨后看到在不少應(yīng)用中CRISPRs迅速崛起,多個(gè)不同物種都實(shí)現(xiàn)了基因組中基因刪除和插入,激活或抑制基因轉(zhuǎn)錄。但是隨著這一系統(tǒng)越來(lái)越受歡迎,關(guān)于其特異性和有效性的質(zhì)疑也越來(lái)越多。

如何提高導(dǎo)向RNA(gRNA)的特異性是一大問(wèn)題,這種RNA能將Cas9核酸酶帶領(lǐng)到基因組目標(biāo)位置,NatureBiotechnology雜志建議切斷gRNAs(Nature子刊:巧解基因編輯脫靶問(wèn)題),減少脫靶問(wèn)題,而且不影響靶標(biāo)活性,而另外一個(gè)研究組則建議更長(zhǎng)一些的gRNAs(Analysisofoff-targeteffectsofCRISPR/Cas-derivedRNA-guidedendonucleasesandnickases)。

這明顯是有些自相矛盾的建議,前者的研究人員指出只是簡(jiǎn)單截短了gRNA靶標(biāo)區(qū)域的長(zhǎng)度,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在之前檢測(cè)到的脫靶位點(diǎn),脫靶突變都大幅減少,與全長(zhǎng)gRNA相比,一些位點(diǎn)的突變頻率甚至減少了5,000倍以上。重要的是在靶向它們的預(yù)定目標(biāo)DNA時(shí),這些縮短了的gRNA(稱為tru-gRNA)與全長(zhǎng)gRNA同樣有效。而后者則發(fā)現(xiàn)選擇合適的靶標(biāo)序列,優(yōu)化gRNA和Cas9,就能避免或者減少脫靶突變的出現(xiàn)。

另外一個(gè)問(wèn)題是如何篩選脫靶,以及中對(duì)于研究的影響有多少?梢则(yàn)證gRNAs錯(cuò)配候選位點(diǎn)的方法也許會(huì)錯(cuò)失一些關(guān)鍵的剪切位點(diǎn),而且全基因組測(cè)序也不是非常有效,目前我們需要一種敏感且無(wú)偏差的方法,來(lái)標(biāo)記Cas9靶標(biāo)位點(diǎn),并令它們能在整個(gè)基因組中被識(shí)別出來(lái)。

其它的令這一系統(tǒng)特異性更強(qiáng)的方法還有,用配對(duì)替換切口酶(nickases)替換Cas9核酸酶(前者每次只能切斷DNA一條鏈),或者將Cas9突變?nèi)诤系紽ok1這種需要催化激活的核酸酶中去。此外,通過(guò)來(lái)自不同物種的Cas9也能增加靶向多個(gè)位點(diǎn)的靈活性,進(jìn)一步改善Cas9-gRNA復(fù)合物的傳遞系統(tǒng),也有助于增加效率。

盡管Cas9潛力無(wú)限,但是這還是一種細(xì)菌的蛋白,對(duì)于一些應(yīng)用,尤其是臨床上的應(yīng)用來(lái)說(shuō),還需要尋找真核生物核酸酶進(jìn)行替換。對(duì)于植物來(lái)說(shuō),一些Argonaute核酸酶能通過(guò)小RNAs靶向DNA,這也是基因組編輯可以考慮的一個(gè)方向。


本文來(lái)自:逍遙右腦記憶 http://www.yy-art.cn/gaozhong/763425.html

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