奶山羊不但是重要的奶源，也在發(fā)展中國家中承擔著重要的農(nóng)業(yè)和經(jīng)濟作用。了解山羊乳腺的遺傳背景對研究控制組織功能和乳成分合成的調(diào)控機制十分重要。然而山羊乳腺完整轉(zhuǎn)錄組信息的缺乏卻阻礙了相關(guān)工作的開展。為此，西北農(nóng)林科技大學羅軍教授領(lǐng)銜的團隊對奶山羊乳腺組織的轉(zhuǎn)錄組進行了全面測定和深入分析，相關(guān)成果發(fā)表在近期的FunctIntegrGenomics上。

羅教授的團隊收集了山羊乳腺發(fā)育四個不同階段的組織，采用轉(zhuǎn)錄組denovo測序?qū)ζ滢D(zhuǎn)錄組進行測定，共產(chǎn)生約25GB序列信息（轉(zhuǎn)錄組denovo測序項目由聯(lián)川生物承擔完成）。序列拼接組裝獲取了51,361個Unigenes，約60.07%的Unigenes與NR數(shù)據(jù)庫中蛋白具有同源性。進一步通過KOG，GO，和KEGG進行功能分類，發(fā)現(xiàn)來自山羊乳腺的Unigenes參與多種生物過程和代謝途徑，包括脂質(zhì)代謝和乳糖代謝。定量PCR發(fā)現(xiàn)，相比于非泌乳期，編碼FABP3，F(xiàn)ASN，SCD，PLIN2，乳清蛋白（LALBA和BLG），以及酪蛋白（CSN1S1，CSN1S2，CSN2和CSN3）的基因在產(chǎn)后100天和產(chǎn)后310天出現(xiàn)顯著高表達。除了它們在脂質(zhì)和蛋白質(zhì)合成中的作用，在產(chǎn)后310天出現(xiàn)高表達可能有助于懷孕期乳腺細胞的更新。

上述研究是首次全面地測定和描述了山羊乳腺轉(zhuǎn)錄組，為今后研究反芻動物的泌乳提供了基因組資源。

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