我看DNA結(jié)構(gòu)探索過(guò)程

編輯: 逍遙路 關(guān)鍵詞: 高中化學(xué) 來(lái)源: 高中學(xué)習(xí)網(wǎng)

楊謙

  毫無(wú)疑問(wèn),生命科學(xué)與化學(xué)有著密不可分的聯(lián)系,我甚至認(rèn)為生命科學(xué)就是用化學(xué)來(lái)解釋生命。然而,僅僅知道一種物質(zhì)的化學(xué)成分是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,結(jié)構(gòu)才是其功能的基礎(chǔ)。我們知道,構(gòu)成元素相同的物質(zhì),由于結(jié)構(gòu)不同,可能在功能上就相去甚遠(yuǎn):左、右旋光物質(zhì)的不同生理作用就是一個(gè)很好的例子。但是,我們不能孤立地來(lái)闡述生命科學(xué)與結(jié)構(gòu)化學(xué)的關(guān)系,也就是說(shuō)不能把生命科學(xué)看成一塊,再把結(jié)構(gòu)化學(xué)看成另一塊,然后再說(shuō)明他們間千絲萬(wàn)縷的聯(lián)系;我認(rèn)為,結(jié)構(gòu)化學(xué)與生命科學(xué)是揉合在一起的,很多結(jié)構(gòu)化學(xué)家在生命科學(xué)領(lǐng)域就有不凡的建樹。鮑林就是以化學(xué)向生物學(xué)滲透的先驅(qū)者,他不僅進(jìn)行了大分子研究,還對(duì)鐮刀形細(xì)胞貧血分子病和大腦化學(xué)進(jìn)行了大量的研究。然而我認(rèn)為,最能體現(xiàn)結(jié)構(gòu)化學(xué)與生命科學(xué)揉合一體的歷史故事,就是鮑林與沃森和克里克關(guān)于DNA結(jié)構(gòu)之爭(zhēng)。在這個(gè)過(guò)程中,我們無(wú)法定義他們到底是化學(xué)家還是生物學(xué)家。而且,結(jié)構(gòu)化學(xué)的知識(shí)不僅為他們建立模型提供了理論支持,而且在幫助他們判別真理與謬誤、為他們的結(jié)論提供事實(shí)支持等方面起到了至關(guān)重要的作用。從這個(gè)故事中我們不僅可以看出,解決DNA結(jié)構(gòu)這個(gè)世界性的生命科學(xué)課題,是許多化學(xué)家、物理學(xué)家、晶體學(xué)家、生化學(xué)家共同努力的結(jié)果
在一九二四年以前,沒(méi)有一個(gè)人真正懂得DNA的重要性。但就在那一年,科學(xué)家羅伯特?福爾根發(fā)現(xiàn)了一種方法能將DNA染成淡紫色。在這種方法的幫助下,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)DNA僅存在于細(xì)胞核中。到了一九三一年,科學(xué)家喬基姆?哈默林用實(shí)驗(yàn)證明了植物長(zhǎng)成什么樣子完全取決于細(xì)胞核。隨后的一切實(shí)驗(yàn)事實(shí)都表明,發(fā)出遺傳信息的正是細(xì)胞核里的DNA。

  于是,在美洲和歐、亞、非三洲各試驗(yàn)室里的人們都開始研究這個(gè)問(wèn)題。在美國(guó),著名的化學(xué)家萊納斯?鮑林開始了對(duì)DNA的研究。在劍橋大學(xué)的卡文迪斯實(shí)驗(yàn)室里,英國(guó)人弗朗西斯?克里克和美國(guó)人詹姆斯?沃森也著手進(jìn)行對(duì)奇異的DNA結(jié)構(gòu)的探索。這是一場(chǎng)用結(jié)構(gòu)化學(xué)來(lái)解釋生命科學(xué)的競(jìng)賽,也是“一個(gè)遠(yuǎn)方傳奇大力士被兩個(gè)無(wú)名小卒砍倒的故事”。雖然我們已經(jīng)知道了這場(chǎng)競(jìng)賽的結(jié)果,但我認(rèn)為,這一探索的過(guò)程更讓人留下深刻的印象。我將雙方的研究進(jìn)行了一些對(duì)比,確實(shí)從中學(xué)到了一些東西,希望和大家一起探討。

一、雙方的開端:

  當(dāng)時(shí)的鮑林已經(jīng)是化學(xué)界的“權(quán)威”,他致力于蛋白質(zhì)的研究。1951年夏天,鮑林開始深入研究有關(guān)DNA的材料,并常常找人討論。他認(rèn)為,與蛋白質(zhì)相比,弄清DNA的結(jié)構(gòu)不會(huì)很難,“這算不上一個(gè)最為緊迫的問(wèn)題”。DNA在重量上是染色體的一種重要成分,但蛋白質(zhì)也一樣。大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為,蛋白質(zhì)部分最有可能包含著遺傳的信息。相對(duì)而言,DNA似乎就比較簡(jiǎn)單了,它很可能只是一種結(jié)構(gòu)性的成分,只是用來(lái)幫助染色體折疊和打開的。鮑林就這樣認(rèn)為。在1952年初,幾乎所有重要的遺傳學(xué)學(xué)者都持這一種觀點(diǎn)。我們可以看看后來(lái)鮑林自己的話:“我以前就知道DNA是一種遺傳物質(zhì)的論點(diǎn),然而我沒(méi)有接受這一論點(diǎn)。你們知道,那時(shí)我正熱衷于蛋白質(zhì)的研究,我認(rèn)為蛋白質(zhì)最有可能是遺傳物質(zhì),不可能是核酸當(dāng)然,核酸也有作用。在我著述的有關(guān)核酸的文字材料中,我總會(huì)提到核蛋白的概念。當(dāng)時(shí),我考慮得更多的是蛋白質(zhì),而不是核酸!彪m然如此,鮑林還是著手研究DNA的結(jié)構(gòu)。此時(shí),

    他需要清晰的DNAX光照片,他曾先后寫信給相片持有者物理學(xué)家威爾金斯(英國(guó))及其上司,但均遭拒絕。1951年11月,《美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)學(xué)報(bào)》上刊登了一篇論述DNA結(jié)構(gòu)的文章。鮑林據(jù)其深厚的結(jié)構(gòu)化學(xué)基礎(chǔ),一下子?是如何構(gòu)筑起來(lái)的問(wèn)題。鮑林設(shè)想,如果堿基朝外,那么螺旋的內(nèi)核就應(yīng)當(dāng)是由磷酸堆積起來(lái)的。磷酸聚集在中間,堿基朝外,這與X射線的資料是“吻合”的。在鮑林的頭腦中,DNA結(jié)構(gòu)的問(wèn)題就已經(jīng)轉(zhuǎn)化為如何將磷酸堆積在一起的問(wèn)題了。我們現(xiàn)在知道,鮑林的這一開端是錯(cuò)的,并最終使他敗給了沃森和克里克。另外還必須一提的是,鮑林對(duì)DNA研究總是被各種事務(wù)打斷,使他曾多次中斷自己的思路。是否是因?yàn)轷U林沒(méi)能看到威爾金斯的相片而導(dǎo)致他的失敗呢?暫且不回答這個(gè)問(wèn)題,我們先來(lái)看看沃森和克里克是如何開始的。
 
  在戰(zhàn)爭(zhēng)期間,克里克原來(lái)是從事武器方面研究的。后來(lái)他決定研究生物。于是他到劍橋大學(xué)學(xué)習(xí)分子學(xué)。至于沃森,他本來(lái)就一直在研究DNA。他到劍橋大學(xué)是為了對(duì)此作進(jìn)一步的研究。他們都是熱心探索的人!拔?克組合”相對(duì)于鮑林的地位可以說(shuō)是“一個(gè)在天,一個(gè)在地”,他們并沒(méi)有引起人們多大的重視,也沒(méi)有引起鮑林的注意。他們就憑著一股勁和對(duì)目標(biāo)的執(zhí)著追求開始了他們的研究。還必須提到的是另外兩位對(duì)他們的成功起著至關(guān)重要的作用的人:一位是上文提到的物理學(xué)家威爾金斯,另一位是青年女晶體學(xué)家羅莎琳德?富蘭克林。他們拍出了非常漂亮的DNAX光照片,不僅啟發(fā)了沃森和克里克,而且為他們的發(fā)現(xiàn)提供了佐證。

  鮑林頗為自信,感到自己有能力解開DNA之謎。唯一的問(wèn)題是,會(huì)不會(huì)有人搶先取得勝果,但是,他不會(huì)把這一點(diǎn)真正放在心上。他認(rèn)為威爾金斯和富蘭克林兩人(更不用說(shuō)沃森和克里克了),沒(méi)有誰(shuí)有足夠的化學(xué)基礎(chǔ)對(duì)鮑林產(chǎn)生嚴(yán)重的威脅。

二、對(duì)對(duì)手的不同看法:

  鮑林是自負(fù)的,他不相信有人能夠在他之前發(fā)現(xiàn)DNA的結(jié)構(gòu),特別是他認(rèn)為沒(méi)有人有他那樣深厚的化學(xué)功底。他“知道”,沃森是一個(gè)好學(xué)生,但因成績(jī)還不夠突出,因而他到加州理工學(xué)院當(dāng)研究生的申請(qǐng)未被批準(zhǔn)。克里克已經(jīng)三十五六歲了,還在讀研究生,年齡是大了一些。況且,卡迪文斯實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)家們至今尚未在任何競(jìng)賽中打敗過(guò)鮑林。甚至有人認(rèn)為,沃森和克里克看上去就像是一對(duì)“雜耍演員”。

  而沃森和克里克則不同。對(duì)于年方19的沃森來(lái)說(shuō),鮑林是一位值得仿效的榜樣。在盧瓦蒙會(huì)議上,沃森就是圍聚在鮑林身邊的人之一,他十分用心地聽了鮑林的講話?死锟碎_始并不是鮑林的崇拜者,他是鮑林的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手,因?yàn)轷U林曾用阿爾法螺旋表明他們的一篇關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的論文漏洞百出,讓克里克承受了由此而來(lái)的屈辱。從此,克里克借鑒了鮑林的研究方法。說(shuō)實(shí)話,他們對(duì)鮑林這位怪杰都極為佩服。更重要的是,他們兩人都互相傾慕,他們可謂是天生一對(duì)。相對(duì)于鮑林來(lái)說(shuō),沃森和克里克謙遜多了。

三、研究方法及進(jìn)程:

  鮑林首先想到DNA的結(jié)構(gòu)可能是螺旋型,因?yàn)槠渌麡?gòu)型與他所看到和掌握的照片資料不相符合。但他認(rèn)為,DNA是由三條鏈互相纏繞在一起,磷酸處于中央的位置。之后,他的工作重點(diǎn)就聚焦于找出磷酸分子在中央合理的排列方法。雖然他知道自己提出的構(gòu)型不能完美地符合實(shí)驗(yàn)測(cè)算得出的數(shù)據(jù)和X光衍射照片,但他認(rèn)為這些都只是細(xì)枝末節(jié)的東西,就像他發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)阿爾法螺旋一樣開始的時(shí)候也有難以解釋的數(shù)據(jù),他大膽地將之忽略,而其后的事實(shí)證明了他這種策略是明智的。另外,鮑林有些急于求成,他希望能夠盡快地發(fā)表相關(guān)文章,搶在其他科學(xué)家之前,宣布自己再次成功地解決了又一世界性的難題。于是,他很快地發(fā)表了他“發(fā)現(xiàn)”的DNA結(jié)構(gòu)。

  鮑林將自己的論文也寄給了沃森和克里克。他們兩人虛驚了一場(chǎng),因?yàn)樗麄儼l(fā)現(xiàn),鮑林設(shè)想的這種構(gòu)型是他們最初設(shè)想的結(jié)果,當(dāng)時(shí)他們將這一結(jié)果給晶體學(xué)家富蘭克林看的時(shí)候,被她以充足的論據(jù)否認(rèn),因?yàn)樗萘繂?wèn)題與這種構(gòu)型嚴(yán)重不符。也正是因?yàn)檫@次錯(cuò)誤,他們兩人被認(rèn)為不適合研究DNA構(gòu)型問(wèn)題,被拆散到不同的課題組,從事別的研究。但沃森和克里克并沒(méi)有就此放棄,他們?nèi)匀凰较聢?jiān)持不懈地進(jìn)行研究和探索。他們?cè)谘芯糠椒ㄉ弦恢本陀泄沧R(shí):與其推導(dǎo)出復(fù)雜的數(shù)學(xué)模型,直接而又明確地解釋X光的衍射結(jié)果,還不如借助化學(xué)常識(shí)構(gòu)筑結(jié)構(gòu)的一個(gè)模型。正如沃森所說(shuō),他們決定“仿效鮑林,并在他本人發(fā)起的這場(chǎng)競(jìng)賽中將他擊敗”。富蘭克林的批評(píng)已經(jīng)促使他們將磷酸放到了分子的外側(cè);又受到奧

    地利生物化學(xué)家切加夫的啟示,得知內(nèi)側(cè)各對(duì)堿基之間存在著一一對(duì)應(yīng)的關(guān)系。他們開始設(shè)想,在螺旋中,嘌呤和嘧啶以某種方式挨次排列在分子中心下部。之后,他們看到了富蘭克林最新的DNA照片,不僅使他們確認(rèn)了DNA是一種螺旋,而且他們得到了幾個(gè)主要參數(shù)。由此,他們開始著手制造模型,通過(guò)不懈的努力,最終獲得了成功。

  可以看出,不論是成功者還是失敗者,他們都用了一種結(jié)構(gòu)化學(xué)中重要的研究方法建模。同時(shí),沃森和克里克不僅受到了多學(xué)科領(lǐng)域的科學(xué)家的啟示和幫助,而且他們自己都承認(rèn),他們的研究方法來(lái)源于偉大的化學(xué)家鮑林。由此可見,生命科學(xué)是集多學(xué)科,特別是化學(xué)的大成所在,他與化學(xué),乃至物理、數(shù)學(xué)的揉合可見一斑。

為什么鮑林會(huì)失?

  鮑林有著深厚的化學(xué)知識(shí)作為自己研究的基礎(chǔ)。照常理而言,成功的應(yīng)該是他,但他為什么輸給了沃森和克里克呢?鮑林輸在浮躁和自負(fù)上。他急于求成,因?yàn)镈NA是當(dāng)時(shí)最大的課題,他要去搶占這一高地。他沒(méi)有把研究的準(zhǔn)備工作做好就想碰碰自己的運(yùn)氣了。同時(shí),他順利解決阿爾法螺旋給他套上了成功的光環(huán),他的確是世界上解決巨分子結(jié)構(gòu)的最佳人選,但他也從此染上了自負(fù)的惡習(xí),他以為自己不再需要做別人需要做的那些研究的準(zhǔn)備工作了。他過(guò)于相信自己的直覺(jué)和運(yùn)氣,結(jié)果輸?shù)袅诉@場(chǎng)大比拼。

沃森和克里克為什么會(huì)成功?
 
  其實(shí)這個(gè)問(wèn)題的答案從前面的敘述中都可以看出,但我覺(jué)得最重要的一點(diǎn)是不懈的思索與踏實(shí)的努力?死锟瞬痪褪窃谝蝾^疼而不得不休息,卻又忍不住開始計(jì)算時(shí)找到了有關(guān)DNA結(jié)構(gòu)的答案嗎?他們雖然被拆散到兩個(gè)不同的研究小組,但仍然踏實(shí)地合作與工作,正是這樣,幸運(yùn)之神才降臨在他們的頭上。另外還有一點(diǎn),就是他們沒(méi)有放過(guò)看似微不足道的東西。奧地利生物化學(xué)家切加夫?qū)A基一一對(duì)應(yīng)的關(guān)系同樣告訴了鮑林,但卻沒(méi)有得到鮑林的重視,而沃森和克里克并沒(méi)有放過(guò)這一點(diǎn),而最終獲得啟發(fā),找到了DNA的正確結(jié)構(gòu)。

  結(jié)構(gòu)化學(xué)與生命科學(xué)的揉合已無(wú)需多說(shuō),我相信這種相互融合在將來(lái)會(huì)愈演愈烈。最后我想總結(jié)的是有關(guān)鮑林的研究方法,畢竟沃森與克里克的成功也來(lái)源于此,相信它對(duì)所有的科研者都會(huì)有所幫助:

鮑林的研究方法

實(shí)驗(yàn)研究和理論探討相結(jié)合

  鮑林比一般的化學(xué)研究生掌握了更多的數(shù)學(xué)和物理學(xué)知識(shí)。他一方面是重視實(shí)驗(yàn),強(qiáng)調(diào)經(jīng)驗(yàn)知識(shí);另一方面又深信化學(xué)結(jié)構(gòu)問(wèn)題可以通過(guò)應(yīng)用現(xiàn)代物理學(xué)的理論來(lái)解決。他常采用半經(jīng)驗(yàn)的方法:既有根據(jù)物理學(xué)基本原理進(jìn)行的演繹推導(dǎo)或論證,又有對(duì)實(shí)驗(yàn)資料的歸納,二者互相補(bǔ)充。

量子力學(xué)與化學(xué)經(jīng)驗(yàn)相結(jié)合

  鮑林在總結(jié)過(guò)去對(duì)離子半徑的研究時(shí)曾指出:“應(yīng)用量子力學(xué)可以近似計(jì)算……但是,這種理論計(jì)算是十分復(fù)雜的,需要很大的工作量;因此,從化學(xué)方面考慮,最好有一套經(jīng)驗(yàn)或半經(jīng)驗(yàn)的離子半徑數(shù)據(jù)……”

他的主要做法是:

  不斷提出新的概念,利用它來(lái)概括實(shí)驗(yàn)資料和總結(jié)化學(xué)結(jié)構(gòu)規(guī)律。

  發(fā)展簡(jiǎn)單的理論。

  努力把量子力學(xué)的研究成果轉(zhuǎn)譯成化學(xué)家的習(xí)用語(yǔ)言。

  采用移植方法開拓邊緣學(xué)科

  鮑林不斷把結(jié)構(gòu)化學(xué)的理論和實(shí)驗(yàn)方法移植到生物學(xué)、醫(yī)學(xué)以及核物理的研究中去。他按照自己的專長(zhǎng)不斷地把新的理論原理和新的實(shí)驗(yàn)方法移植于另一領(lǐng)域,解決新的研究課題,努力開拓新的邊緣學(xué)科地帶。這是他五十多年來(lái)研究成果綿綿不斷的重要原因。

直覺(jué)和模型方法

  在鮑林的研究工作中,直覺(jué)的運(yùn)用占有非常突出的地位。無(wú)論是鮑林本人還是別人對(duì)他的評(píng)述都常常提到直覺(jué)。綜合起來(lái)大致有以下表現(xiàn):

  1.是與數(shù)學(xué)計(jì)算不同的一種尋求答案的方式。

  2.一種好奇心,它引起鮑林對(duì)某個(gè)科學(xué)課題的注意,并直接領(lǐng)悟到有可能用經(jīng)驗(yàn)的方式來(lái)解答它。

  3.和想象一樣,“不能歸結(jié)為僅僅采用通常的邏輯規(guī)則和過(guò)程”,它和某種“深邃的洞察力”有關(guān)。

  4.鮑林對(duì)一個(gè)晶體的結(jié)構(gòu)的確定,分為兩步:一是推測(cè),二是證實(shí)。這種“推測(cè)”,或者是鮑林本人自稱的“隨機(jī)方法”也在直覺(jué)之列。

  5.“借助于對(duì)化學(xué)事實(shí)的非凡記憶”,是“經(jīng)過(guò)實(shí)踐”養(yǎng)成的。

從整體看待世界從實(shí)踐對(duì)待科學(xué)

  鮑林作為一位自然科學(xué)家,物質(zhì)世界的統(tǒng)一性對(duì)于他來(lái)說(shuō)似乎是不言而喻的。鮑林重視理論思維,并不完全同意實(shí)證主義的見解。他強(qiáng)調(diào)自己“是純粹從實(shí)踐的方面對(duì)待科學(xué);可以說(shuō)是實(shí)用地對(duì)待科學(xué)!必灤U林研究方法中的極其寶貴的思想正是這種“從實(shí)踐的方面對(duì)待科學(xué)”的態(tài)度。

 

 


本文來(lái)自:逍遙右腦記憶 http://www.yy-art.cn/gaozhong/843926.html

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