摘要：據(jù)美國(guó)物理學(xué)家組織網(wǎng)11月8日?qǐng)?bào)道，美國(guó)賓夕法尼亞州立大學(xué)和埃默里大學(xué)的研究人員開發(fā)的新銀河（Galaxy）系統(tǒng)，能利用“云”實(shí)現(xiàn)科學(xué)家對(duì)于與DNA（脫氧核糖核酸）測(cè)序和分析等相關(guān)軟件工具的“駕馭”，并存儲(chǔ)大量科學(xué)數(shù)據(jù)。相關(guān)研究進(jìn)展將發(fā)表在《自然?生物技術(shù)》雜志上。
據(jù)美國(guó)物理學(xué)家組織網(wǎng)11月8日?qǐng)?bào)道，美國(guó)賓夕法尼亞州立大學(xué)和埃默里大學(xué)的研究人員開發(fā)的新銀河（Galaxy）系統(tǒng)，能利用“云”實(shí)現(xiàn)科學(xué)家對(duì)于與DNA（脫氧核糖核酸）測(cè)序和分析等相關(guān)軟件工具的“駕馭”，并存儲(chǔ)大量科學(xué)數(shù)據(jù)。相關(guān)研究進(jìn)展將發(fā)表在《自然?生物技術(shù)》雜志上。
生物化學(xué)和生物學(xué)實(shí)驗(yàn)經(jīng)常會(huì)產(chǎn)生如山的數(shù)據(jù)，如何分析這些數(shù)據(jù)令科學(xué)家十分頭疼。Galaxy計(jì)算系統(tǒng)是為數(shù)據(jù)密集的生物醫(yī)藥和基因研究而設(shè)的、基于網(wǎng)絡(luò)的開源平臺(tái)。其能通過聚集多個(gè)具備快速檢索功能和海量數(shù)據(jù)分析功用的工具，簡(jiǎn)化基因組分析的工程，從而解決科研人員面臨的難題。
“云”是強(qiáng)大計(jì)算機(jī)的基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)，可以遠(yuǎn)程使用，無需擔(dān)心過熱、過冷和系統(tǒng)管理。這種系統(tǒng)允許用戶無論身處何方，都能轉(zhuǎn)換軟件存儲(chǔ)的工作量和硬件的基礎(chǔ)架構(gòu)，以配合遠(yuǎn)程的網(wǎng)絡(luò)計(jì)算機(jī)，同時(shí)近乎支持無限的計(jì)算能力。科研人員無需在自己的電腦上運(yùn)行Galaxy，或者使用大學(xué)的服務(wù)器進(jìn)入Galaxy，卻仍能成為“云”的駕馭者。系統(tǒng)綜合了現(xiàn)有基因組數(shù)據(jù)庫(kù)和簡(jiǎn)易網(wǎng)絡(luò)的力量，可令用戶搜索遠(yuǎn)程的資源，整合單獨(dú)的查詢數(shù)據(jù)，并令結(jié)果可視化。同時(shí)，其他實(shí)驗(yàn)室的科研人員也可以查看Galaxy的工作進(jìn)程，例如查看對(duì)于遺傳密碼的分析，賦予科學(xué)極大的透明性。
研究小組在之前發(fā)表的論文里，描述了如何利用Galaxy云服務(wù)為9個(gè)人分析DNA。基于這個(gè)平臺(tái)的超強(qiáng)計(jì)算能力，科研人員能夠識(shí)別出4個(gè)單細(xì)胞內(nèi)含有兩種或兩種以上的細(xì)胞質(zhì)的區(qū)域，即線粒體內(nèi)的變異，基因組的這個(gè)部分會(huì)由母親遺傳給孩子。
此外，Galaxy云服務(wù)的一大優(yōu)勢(shì)就是它的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和計(jì)算能力。科研人員表示，新興技術(shù)將產(chǎn)生比現(xiàn)有的下一代DNA測(cè)序多100余倍的數(shù)據(jù)，但目前這些數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)已經(jīng)成了問題，更不必說對(duì)其進(jìn)行分析。而使用網(wǎng)絡(luò)云服務(wù)，研究人員可以選擇在安全的地方存儲(chǔ)大量數(shù)據(jù)。
Galaxy的云服務(wù)還具有其他優(yōu)點(diǎn)，例如可讓對(duì)于計(jì)算機(jī)了解不多的科學(xué)家也能使用不易接觸的DNA分析工具，因此不需要在計(jì)算機(jī)的基礎(chǔ)建設(shè)方面過多投資，也能保證數(shù)據(jù)密集、復(fù)雜的科學(xué)分析得以執(zhí)行。
本文來自：逍遙右腦記憶 http://www.yy-art.cn/gaozhong/895679.html
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